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应对实验可重复性危机:数据共享或是大势所趋?

9月7日,Nature出版集团发布一则关于实验数据共享的公告,即从本月起所有被Nature及12家子刊所接收的论文必须提供是否能够以及如何获取相关原始数据。

原文:

Starting this month, all research papers accepted for publication in Nature and an initial 12 other Nature titles will be required to include information on whether and how others can access the underlying data.

可重复性危机(Reproducibility Crisis)

实验的可重复性是科学研究中最基本、最核心的要素,倘若实验不能被重复,那么所有的成果和结论显然无法立足。然而,在目前的科研界中,可重复性逐渐成为了一个世界公认的、亟待解决的危机。上月,Nature期刊的一篇新闻特稿对可重复性危机作了调查。在1576名研究人员的调查样本中,90%的人认为目前的科学研究存在可重复性危机,52%的人则认为存在重大的危机。

数据共享究竟有无必要?

对于是否有必要公开所有数据,长期以来就存在一定的争论。由于目前绝大部分期刊都无须作者提供原始数据,有些期刊只是当有人来信提出疑义时才会要求作者共享数据。一般来说,随着时间延长,作者愿意共享数据的态度也会随之减弱。长期以来人们都对实验数据透明化看得比较淡,认为原始数据是归属个人的,无须公布于众。

然而,这就造成了仅凭论文中提及的实验步骤,许多研究工作会无法被同行重复出来。这其中的原因有很多。当然,首先必须明确的是,“不可重复”并不就是“学术造假”,有可能是实验本身的技巧性强、不可控的影响因素多(尤其是一些生物、医学领域的研究),也可能是论文中表达不准确或不全面,因为有些科研人员并不太愿意让自己的核心技术被太快传播,可能会在论文中特意写的比较模糊。此外,援引“生物谷”上发表的一篇文章:“除了科学上存在发表压力之外,还存在很多其他可能的因子也能够导致这种不可重复性:对结果的选择性报道、缺乏对基础统计学原理的理解和较差的实验设计都会导致这种普遍存在的现象。其他的因子包括来自资深研究人员的不充分指导;欺骗;在一种“不发表就完蛋”的环境中,实验室成员之间的高度竞争;开展研究时没有足够的资源可供使用。在发表的研究中详细实验方法的缺乏可能也导致不可重复性。”

在我国科研环境下,一旦有一个新技术或新方法问世,许多研究人员可能会习惯性地去做点改良,然后投一些影响力稍低的期刊,但前提就是必须先重复出来,一旦在重复性上出现问题则会引起巨大的反响和质疑,诸如韩春雨老师的NgAgo实验重复性风波至今仍未平息。此时,如果期刊在投稿前就强制作者公开实验数据作为参考,也许会少去很多质疑声。

共享数据在一定程度上能够缓解日益严重的可重复性危机以及一些数据造假的学术不端行为。当然,如果是作者自己本身就难以重复实验或是蓄意造假,想必他也不会主动去共享实验数据吧。特别是一些发表在顶尖刊物上文章,无疑会受到更大的关注,因此,作者事先做好论文可重复性的控制是很有必要的。

数据共享或是大势所趋?

今年3月,Nature的5家子刊,包括Nature Cell Biology, Nature Communications, Nature Geoscience, Nature Neuroscience, 和Nature Physics,已开始尝试要求作者提供数据共享声明。此次的公告更是将需要数据公开的期刊范围进一步扩大,同时预计在2017年初推广至Nature旗下所有期刊。

其实在此之前,已经有一些期刊及出版社对数据公开提出了明确的要求,例如全球发文量最大的期刊PLoS One就是如此。早在2014年,PLOS系列的期刊就要求作者必须公开所有支撑论文结果的数据,将其共享至公共数据库中。其规定了必须共享的数据条件:用来得到论文结论的数据以及能够用来让他人重复研究的方法,而“data not shown”是不能被接收的。此外,从2017年起,Science也将实行TOP(Transparency and Openness Promotion)标准,意味着实验数据也要被公开。

推行这样的数据共享举措显然也是为了使研究工作更透明化,方便更多作者能够理解并重复他人的研究方法。未来这种数据公开政策可能会被大范围推广,尤其是会在一些知名期刊及出版社中推行。尽管存在争议,或许数据共享政策对整个学术界的发展是利大于弊的。

附:Nature有关数据共享政策的公告
http://www.nature.com/news/announcement-where-are-the-data-1.20541


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客户反馈

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    Computational Intelligence and Neuroscience


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    Journal of Chromatography A


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    Oncotarget


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    BMC genomics


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    Scientific reports


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    Journal of the American College of Cardiology


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